La Universidad de Burgos es la única universidad pública de Castilla y León en ostentar el Certificado Docentia por su calidad docente. La Agencia Nacional de Evaluación de la Calidad y Acreditación (ANECA) y la Agencia para la Calidad del Sistema Universitario de Castilla y León (ACSUCYL) han hecho entrega a la UBU de esta distinción, que solo tienen en vigencia nueve universidades españolas.

El presidente de ACSUCYL, Salvador Rus Rufino, ha sido el encargado de entregar al rector burgalés, Manuel Pérez Mateos, la renovación de este certificado, con validez hasta septiembre de 2023.

El Programa Docentia de la ANECA, que se desarrolla en estrecha colaboración con las agencias autonómicas y en Castilla y León, es el método de control de calidad de la docencia universitaria, que comenzó su andadura en 2007.