La Universidad de Burgos es, junto a la de Vigo, la institución de educación superior más transparente de España, al cumplir con 126 de 137 indicadores de transparencia y buen gobierno, según un informe elaborado por Dynamic Transparency Index (Dyntra) sobre las universidades públicas y privadas españolas. A estas dos universidades les sigue en tercer lugar la Universidad de Valladolid, con 125 indicadores cumplidos. 

En la evaluación de transparencia basada en el índice DUE (Dyntra Universidades) la Universidad de Burgos alcanza un 100% en contratación de servicios, un 93% en transparencia institucional, un 90% en participación y colaboración ciudadana, un 89% en transparencia económica y financiera y un 86% en comunicación pública. 

Dyntra es la primera plataforma colaborativa mundial que trabaja en la medición y gestión del gobierno abierto en las organizaciones y para la sociedad civil. En lo relativo a las universidades, esta entidad evalúa el cumplimiento de un total de 137 indicadores, agrupados en las citadas cinco categorías.