Los municipios afectados, en los que están incluidos sus pedanías, son: Alfoz de Quintanadueñas, Arlanzón, Arraya de Oca, Atapuerca, Barrios de Colina, Burgos -barrios de Cotar, Villafría, Villagonzalo-Arenas, Villalonquéjar y Villatoro, Cardeñuela Riopico, Fresno de Rodilla, Galbarros, Huérmeces, Hurones, Merindad de Río Ubierna, Monasterio de Rodilla, Montorio, Orbaneja Riopico, Pineda de la Sierra, Quinataortuño, Quintanapalla, Quintanilla de Vivar, Rubena, Santa María del Invierno, Sotragero, Urbel del Castillo, Valle de las Navas, Valle de Santibáñez, Valle de Sedano, Villaescusa la Sombría, Villasur de Herreros y Villayerno Morquillas.